Thời hạn ra quyết định xử phạt vi phạm hành chính

Chúng tôi có lập Biên bản vi phạm hành về hành vi không xây dựng công trình xử lý môi trường. Bên cạnh, xử phạt tiền còn có xử phạt bổ sung là đình chỉ hoạt động có thời hạn và buộc áp dung biện pháp khắc phục hậu quả. Tuy nhiên do sơ xuất nên đã để quá thời hạn xử lý. Tôi muốn hỏi bây giờ sẽ áp dụng phạt tiền, bổ sung hay khắc phục hậu quả? Mong được hỗ trợ. Xin cảm ơn.